La suite du film de Macross Frontier: Itsuwari no Utahime. Reprenant l'endroit où le film précédent s'était arrêté, la carrière de Ranka s'épanouit tandis que la santé de Sheryl se détériore rapidement après s'être effondrée lors d'une performance en direct. Dans le même temps, des factions distinctes manœuvrent dans les coulisses pour contrôler la horde de Vajra en utilisant les capacités de chant des deux soutiens-chanteurs. Alors que toute la flotte de Macross Frontier commence à mener la dernière guerre sur le Vajra, Alto fait finalement un choix entre Ranka et Sheryl.