Dans un avenir proche, les humains et les robots coexistent. Une compétition dans laquelle Medarot se dispute, est populaire chez les enfants. La conscience d'un Medarot, efficacement son cerveau, se trouve dans une Médaille qui peut être insérée dans et éjectée du corps du robot. Par hasard, Ikki, neuf ans, trouve une médaille rare, et peu de temps après il a son propre Medarot nommé Metabee. C'est l'histoire de leur amitié et de leur croissance en utilisant la sagesse et le courage pour combattre d'innombrables adversaires dans les combats de robots.