L'histoire se déroule à Seitei Gakuen, une académie privée d'élite qui enseigne tous les niveaux depuis la maternelle jusqu'au collège de Tokyo. Une nouvelle enseignante nommée Minami Yuuri commence sa deuxième année d'enseignement ici, et elle passe maintenant de l'enseignement des élèves du collège à l'affectation qu'elle avait cherchée : la grammaire pour les élèves du secondaire. Malheureusement, elle est affectée à la classe 3-E. La classe, appelée classe X, est un groupe infâme d'aînés qui n'ont pas les compétences nécessaires pour étudier; on dit que tous leurs professeurs précédents ont pris leur retraite en raison d'ulcères ou de névroses. Minami doit essayer de contacter ces étudiants, y compris les six leaders de la classe B6 (Baka 6), et les amener à l'université.