Ken Kaneki en est enfin venu à accepter la partie monstrueuse et avide de chair de lui-même qu'il craint et méprise depuis si longtemps. Après avoir échappé à la captivité et à la torture, Kaneki rejoint Aogiri Tree—l'organisation de ghoul très militante qui l'avait enlevé, amenant ses amis à s'interroger sur son véritable motif et sa loyauté. Alors que la tension entre le gouvernement et les goules continue de monter, la Commission de Counter Ghoul, l'agence anti-goules spécialisée du gouvernement, a intensifié ses efforts pour purger complètement Tokyo des goules. Cela menace la paix éphémère des amis et anciens camarades de Kaneki—les goules du café Anteiku. Conscient de la situation dangereuse, Kaneki doit faire face à plusieurs batailles qui mettent en jeu sa précieuse humanité éphémère.