Depuis la chute de l'organisation DARK, Jiro erre partout et se demande s'il ne reverrait jamais Mitsuko ou non. Pendant son voyage, Jiro rencontre une belle fille nommée Rieko qui protège Akira, un petit garçon du mauvais professeur Gill. Ironiquement, il est le fils du professeur Gill, mais il est aussi la clé de Gill’s menaçant l'arme secrète et ses plans pour conquérir le monde.