Des centaines d'années après l'original, Yamato 2520 relate les aventures du dix-huitième vaisseau pour porter le nom, et sa bataille contre la Fédération Seiren. Sur une planète durement gouvernée par la Fédération Serien, un groupe d'adolescents de la terre découvre l'ancienne hulk du Bataille Yamato de la Fédération de la Terre. En volant son disque de données, les adolescents peuvent utiliser les propres chantiers navals automatisés du Serien pour construire un nouveau Yamato.