L'avenir lointain: L'humanité a établi la ville fortifiée mobile, Plantation, sur les terres en ruines. Dans la ville se trouvaient des quartiers pilotes, Mistilteinn, autrement connu sous le nom de Cage à oiseaux.” C'est là que vivent les enfants... Leur seule mission dans la vie était le combat. Leurs ennemis sont les mystérieux organismes géants connus sous le nom de Kyoryu. Les enfants utilisent des robots connus sous le nom de FRANXX afin d'affronter ces ennemis encore invisibles. Parmi eux se trouvait un garçon qui était autrefois appelé un enfant prodige: le numéro de code 016, Hiro. Un jour, une mystérieuse fille appelée Zero Two apparaît devant Hiro. “ Je t'ai trouvé, ma Chérie.et rdquo;