La manga originale tourne autour du lycéen Ryōta Murakami, qui ne peut oublier son amie d'enfance qu'il a laissé mourir dans un accident. Sentant qu'il doit remplir sa promesse de prouver l'existence des extraterrestres, il a constamment regardé le ciel comme un membre du club d'astronomie. Un jour, une fille du nom de Neko Kuroha qui ressemble exactement à son ami d'enfance apparaît comme un étudiant de transfert. Il s'avère qu'elle est un utilisateur magique qui s'est enfui d'un laboratoire de recherche.