Deux ans après la défaite de Galactor et la mort apparente de Condor Joe, un bateau de croisière est attaqué par le leader X, tuant presque tout le monde à bord. L'une des survivantes, une jeune fille, est capturée par X et rapidement vieillie dans le méchant Gel Sadra, bizarre et à voix masculine. Bien qu'elle ait l'apparence d'un adulte, Gel Sadra n'est pas immunisé pour jeter des tantrums enfantins et se comporter immaturement. Au milieu du renouveau de Galactor, l'équipe Science Ninja est rappelée à l'action, avec un homme louche connu sous le nom de Hawk Getz en remplacement de Joe. Getz est rapidement révélé comme un agent Galactor déguisé (et avait tué l'actuel Getz qui devait rejoindre), et se retrouve tué par une mystérieuse plume shuriken. Après des indices répandus dans les trois premiers épisodes, Joe réapparaît dans le quatrième épisode, ayant en quelque sorte survécu à ses blessures mortelles à la fin de la première série, et rejoint l'équipe. Il est révélé plus tard qu'il a été sauvé par un ex-chercheur galacteur au bord de sa mort, et a fait l'objet de diverses augmentations cybernétiques. Plus tard dans la série, une scientifique connue sous le nom de Dr Pandora est présentée, qui avait perdu son mari et sa fille dans le désastre du bateau de croisière. À son insu, sa fille Sammie a survécu et est en fait Gel Sadra.