Deux ans se sont écoulés depuis la fin du successeur martien Nadesico. Akito et Yurika ont disparu. Les Jovians et les Terriens ont uni leurs forces et Ruri est maintenant capitaine de Nadesico B. À mesure que la popularité de Boson Jumping augmente, un vaste réseau de transport a été développé. Surnommé le Plan Hisago, ce réseau de portails Chulip répond aux mystères derrière les particules de Bose et leur puissance. Si ces secrets devaient tomber entre de mauvaises mains, ça pourrait être un gros problème. Et il y a un gros problème. Un groupe de splinters martiens a lancé une offensive, laissant les Forces unies encerclées et désespérées. Tellement, en fait, que l'ancien équipage du Nadesico est appelé à nouveau au service actif pour une mission spéciale non autorisée-pour nous sauver tous. Est-ce qu'elle a ce qu'il faut ? Qui va gagner la course pour la technologie Boson ? Et qu'est-il arrivé à Akito et Yurika ?