Après la série télévisée de Kimagure Orange Road, Kyosuke et Madoka sont enfin arrivés au point où ils sont proches de la remise des diplômes et doivent décider où ils veulent aller à l'université. Naturellement, ils veulent aller ensemble, donc à côté de toutes les études, ils doivent aussi chercher un bon collège où ils peuvent entrer les deux. Hikaru, encore un an après son diplôme, veut aussi soutenir Kyosuke et le fait à sa façon. Mais pendant qu'elle le fait, Madoka se sent jaloux et raconte ses sentiments à Kyosuke. Et puis Kyosuke doit prendre des mesures pour finalement décider de la fille qu'il aime... ce qui conclut l'histoire de la Kimagure Orange Road.