Kaito Kuroba, un adolescent normal dont le père est souvent absent pour des raisons vaguement définies. Quand son père meurt dans des circonstances mystérieuses, il est informé de l'identité secrète de son père; un célèbre criminel international connu sous le nom de Criminal International 1412: le voleur fantôme, et qu'il a été assassiné par une organisation mystérieuse pour avoir refusé de les aider à récupérer la gemme de Pandore; une pierre mystique dit verser une larme pendant le passage d'une comète particulière, dont la consommation confère l'immortalité. Il s'engage à empêcher l'organisation de gagner l'immortalité, et assume l'identité de son père alors qu'il commence sa quête du joyau. Ses seuls indices quant à l'emplacement du bijou sont qu'il brille en rouge sous la pleine lune et qu'il s'agit d'un doublet : un bijou caché dans un bijou plus grand. Ainsi, il devrait être relativement grand avec une histoire bizarre, et toujours stocké dans un endroit qui ne reçoit jamais le clair de lune. Il recherche donc et vole des pierres précieuses célèbres avec des histoires étranges de zones incroyablement bien défendues, et les retourne toujours après la toute prochaine pleine lune.