D'après la série The Magic Tree House, une série primée de livres pour enfants écrits par l'auteure américaine Mary Pope Osborne. Jack et Annie sont de jeunes frères et sœurs qui trouvent une maison d'arbre magique sur leur chemin de retour après avoir chassé une belette. En utilisant les livres disponibles sur la maison des arbres, ils peuvent voyager dans le temps et l'emplacement. Les deux finissent avec la tâche difficile de recueillir quatre médaillons, chacun caché dans un lieu et une époque différents, afin d'aider un magicien nommé Morgan.