Pendant la guerre d'un an de l'U.C. 0079, la Fédération de la Terre et la Principauté de Zeon se livrent une bataille acharnée au secteur Thunderbolt, une zone de shoal dans l'ancienne Colony Side 4 Moore. Après avoir infiltré avec succès le champ de sniper de Zeon, Io Fleming, pilote et passionné de jazz de la Fédération d'as, contrôle le dernier prototype de Gundam.