Souzou Haran était un brillant scientifique qui menait des recherches sur Mars. Il a créé une forme de vie de cyborg avec la capacité de penser pour lui-même. Ces cyborgs, surnommés les Meganoïdes, ont vite perdu le contrôle et ont tué le Dr Haran avec toute sa famille, sauver son plus jeune fils, Banjou Haran, 16 ans. Banjou s'échappe de Mars sur une fusée avec un super robot solaire appelé Daitarn 3, qui a été construit avec les métaux spéciaux de Mars. Maintenant âgé de dix-huit ans et vivant sur Terre dans un luxueux manoir, Banjou lutte contre les Meganoïdes avec l'aide de son fidèle majordome Garrison et de ses deux magnifiques compagnons Reika et Beauty. Ensemble, ils doivent arrêter les Meganoïdes maléfiques qui aspirent à transformer tous les humains en cyborgs et ainsi améliorer la race humaine.