Mireille Bouquet est un assassin professionnel, et un très bon à ça. Mais quand elle fait suite à un courriel d'une jeune Japonaise nommée Yumura Kirika, l'invitant à faire un pèlerinage dans le passé, sa vie devient encore plus dangereuse qu'elle ne l'est déjà. Maintenant, avec une mélodie hantante invoquant la mémoire d'un événement passé depuis longtemps, Mireille et Kirika décident de travailler ensemble pour trouver la vérité sur une organisation millénaire qui a contrôlé leurs deux vies depuis avant leur naissance. Et le seul indice dans leur recherche, la seule chose dont Kirika se souvient, devient leur nom de code de travail: un nom désignant un destin ancien, de deux jeunes filles qui règnent sur la mort--Noir.