Le jeu de rôle des filles otaku a lieu un peu à l'avenir en 20XX. Akihabara, qui était autrefois appelé la terre sainte d'otaku, est maintenant en déclin après que la culture d'otaku lui-même a décliné. Les joueurs assument le rôle de gestionnaire de l'un des rares magasins d'otaku restants. Le manager aide à élever diverses filles otaku talentueuses, et ensemble, les joueurs et les filles combattent un virus qui infecte le monde de diverses œuvres, tout en récupérant les souvenirs perdus des gens.