En 2047, une forme de vie inconnue et extraterrestre descend sur la Terre, détruisant toutes les grandes villes d'un seul coup. Les survivants unissent et construisent un Diffuseur pour arrêter le Februus, les envahisseurs l'armée allait plus tard nommer le FOS, et une paix temporaire est réalisée. Sautez vers 2053, le présent. Le plan final, Plan Zed, pour reprendre la planète Terre. Une dernière contre-attaque désespérée contre l'ennemi. Hiroshi Akishima, soldat de l'Alliance des Forces de Défense Planétaires, ne voudrait rien de mieux qu'un tir sur les extraterrestres responsables de la mort de son père il y a six ans. Cependant, la nouvelle offensive exige que le Diffuseur soit abandonné, laissant toute la planète à nouveau terriblement vulnérable. L'humanité va-t-elle retrouver les étoiles ou tout perdre dans le jeu final ?