L'anime est mis en place immédiatement après l'arc du Sanctuaire principal après la défaite de Gemini Saga de la manga Sainte Seiya de Masami Kurumada, mais avant l'arc Posieidon. Cependant, alors que la manga originale suivait un garçon nommé Seiya et d'autres saints qui se battent pour protéger la déesse Athena, la nouvelle série suit une Sainte nommée Shō qui lutte contre les divinités diaboliques pour protéger Athena.