L'histoire de l'Empire des Corps a lieu dans l'Europe du XIXe siècle, et tourne autour de John Watson. Il est repéré par le gouvernement pour devenir un agent secret. Cependant, Watson vit dans un monde où Frankensteins-des cadavres humains qui sont réutilisés avec une fausse âme pour les utiliser comme ouvriers- sont utilisés pour améliorer le développement industriel.