Toute la population d'une ville a disparu – avantagée sans laisser de trace. Yuki, le seul survivant, rejoint Takuya, un messager contractuel, dans un voyage périlleux pour trouver des réponses dans la ville fantôme nouvellement nommée. Avec une lettre du père de Yuki comme seule tête de la paire, une organisation secrète refuse de laisser Yuki et Takuya se mêler sans contrôle.