Dans la théocratie pacifique de Simulicram, tout le monde est né femelle. À 19 ans, chaque jeune fille subit une cérémonie spéciale où elle choisit son sexe. Toutefois, seules les paires de jeunes prêtresses peuvent se synchroniser avec les anciens navires volants connus sous le nom de Simoun nécessaires pour défendre Simulicram. Ces paires s'abstiennent de subir la cérémonie tant qu'elles souhaitent continuer à piloter leur Simoun. Aer est recruté pour être pilote Simoun après une attaque terrifiante par une nation ennemie décime l'escadron connu sous le nom de Chor Tempest. Pour gagner ses ailes, elle doit trouver son chemin dans le cœur de Neviril, Regina de Chor Tempest. Mais le cœur de Neviril appartient toujours à sa précédente paire, perdue dans la bataille quand elle a tenté une manœuvre interdite de Simoun.