Chaque épisode met l'accent sur les aventures et les mésaventures de Nuku au lycée, et sur sa relation avec les étudiants, la série d'intrigues se concentre sur le projet maléfique de Mishima Industries de dominer le monde à travers ses produits. En opposition à ce plan sont le peu de noix Kyuusaku Natsume et Nuku Nuku, l'androïde qui agit comme un compagnon de son jeune fils. Les camarades de classe de Nuku sont tous excentriques, Futaba, la présidente de la classe, est un dominateur de contrôle, qui ne peut pas laisser son autorité à l'école. Chieko Shirakaba est le snob riche avec les deux oui-filles qui prennent toujours son parti. Il y a un ver à livres, un mystique, un scientifique et un chanteur pop. Tous ces éléments sont fidèles à leurs descriptions : le mystique prévient toujours la mort par des cartes tarotes, des esprits ou une autre technique occulte. La chanteuse pop ne dit rien sauf comme une chanson. Le ver a toujours son nez dans un livre. Ces excentricités ajoutent à l'humour de la série.