L'histoire se déroule dans l'année 311 du calendrier orbital, lorsque l'humanité a migré vers d'innombrables colonies dans l'espace. Une fille de colonie spatiale nommée Akiha Shishidou rencontre une intelligence artificielle malveillante nommée Leopard qui a été installée sur une colonie. Akiha est accompagné d'un policier inter-colones nommé Itsuki Kannagi, une jeune fille taciturne nommée Honoka Kawai, et d'un robot nommé Imoko Imo-chan Shishidou.