Au sud du Japon se trouve une île verdoyante appelée Southern Cross Isle. Une nuit, un garçon du nom de Takuto Tsunashi se lave sur le rivage de l'île. Ayant nagé du continent seul et sans possession, il s'inscrit au niveau supérieur dans l'école de l'île - Southern Cross High School. Avec sa personnalité brillante et positive, il commence à se mélanger avec divers élèves de l'école et construit des relations avec beaucoup d'entre eux, y compris Wako Agemaki et Sugata Shindou. Mais cette école cache un secret profond. Il y a des géants endormis cachés sous le sol appelé Cybodies. Il y a environ 20 de ces géants, et ils ne sont que quelques-uns des différents secrets conservés par tout le monde sur l'île: Les mouvements secrets de la mystérieuse organisation appelée Glittering Crux. Les chansons des jeunes filles du sanctuaire. Et même Takuto lui-même viendra bientôt pour embrasser un grand secret... Cette île dans les territoires du sud entourés par la mer bleue et le ciel bleu est la scène où l'Eulologie de la jeunesse remplie d'amour, de rêves et d'amitiés, va commencer.