L'histoire du roman original de Subete ga F ni Naru tourne autour de Souhei Saikawa, membre du Laboratoire de recherche Saikawa. Il part en vacances au laboratoire, et Moe Nishinosono, la fille de son mentor, rejoint le groupe pendant leurs vacances bien qu'elle ne fasse pas partie du laboratoire. Là, les deux finissent par trouver un cadavre. Les deux travaillent ensemble pour résoudre les mystères de ce qui devient une affaire de meurtre en série.