En 1882, Sanshirou vient à Tokyo chercher un professeur digne d'arts martiaux. Là, il rencontre Yano - un maître du judo qui, à lui seul, bat 39 pratiquants du jujitsu. Très impressionné par son talent, Sanshirou décide de devenir son disciple. Plus tard, Sanshirou tombe pour Sayo Murai - une fille dont le père est un instructeur d'arts martiaux au département de police local; et il doit également faire face à Higaki Gennosuke, un combattant jujitsu qualifié et son plus grand rival.