Ryuuji Takasu est un lycéen gentil qui aime les travaux ménagers. Mais contrairement à sa nature aimable, il a un visage intimidant qui le fait souvent passer pour un délinquant. De l'autre côté, il y a Taiga Aisaka, une petite étudiante à l'allure de poupée, qui est tout sauf une fille mignonne et fragile. Équipée d'un katana en bois et d'une personnalité fougueuse, Taiga est connue dans toute l'école comme le "Tigre du Palmier".
Un jour, une erreur embarrassante amène les deux élèves à se croiser. Ryuuji découvre que Taïga a en fait un côté doux : elle a le béguin pour le populaire vice-président, Yuusaku Kitamura, qui se trouve être son meilleur ami. Mais les choses deviennent encore plus folles lorsque Ryuuji révèle qu'il a le béguin pour Minori Kushieda - la meilleure amie de Taiga !
Toradora ! est une comédie romantique qui suit ce duo étrange alors qu'ils s'embarquent dans une quête pour s'aider mutuellement avec leurs béguins respectifs, formant une alliance improbable dans le processus.