Biblia Koshodou no Jiken Techou est une série de mystères où Shinokawa Shioriko, un jeune propriétaire d'une librairie à Kamakura, dévoile les mystères des livres anciens qui y sont emmenés. L'histoire commence avec un jeune homme nommé Daisuke, qui a grandi pratiquement sans lire des livres en raison d'une phobie, apporte les œuvres complètes (et autographiées) de Natsume Soseki, écrivain japonais de l'époque Meiji, hérité de sa grand-mère dans la mystérieuse librairie. Le timide et introverti Shioriko va-t-il résoudre le mystère des livres ?