Le film raconte l'histoire d'amitiés entre trois enfants et yo-kai. Le film se déroule dans les années 1960 à Tokyo, à Sakura Motomachi. Un garçon nommé Shin vit une vie pauvre mais heureuse. Quand sa mère — son seul membre de la famille — meurt, le malheur de Shin frappe le fond du rocher. C'est alors qu'un autre garçon nommé Itsuki sauve Shin. Itsuki a également perdu sa sœur aînée. Shin, Itsuki, et une jeune fille nommée Tae qui peut voir yo-kai devenir amis. L'esprit gardien de Shin Suu-san, un chat Nekomata, et d'autres nouveaux yo-kai se joignent à leur groupe, et ce groupe est en mesure de retrouver ce que signifie avoir une famille précieuse. Cette nouvelle famille doit maintenant faire face à un incident mystérieux, et une réalité choquante les attend.