Saya Otonashi, une étudiante apparemment normale du secondaire, souffre d'amnésie et elle ne se souvient pas de l'année passée de sa vie. Un jour, après qu'un homme soit apparu et lui donne une épée katana, son destin commence à être révélé. Elle se retrouve bientôt face à la dernière menace pour l'humanité - des monstres chiroptères, des créatures immortels raveuses qui peuvent changer leur forme, se déguisant en êtres humains. Ils se nourrissent de sang et se cachent dans le monde humain. Une organisation connue sous le nom de Bouclier Rouge a mené une guerre privée pour les éliminer et maintenant la lutte s'est développée. Le voyage de Saya pour la vérité a commencé.