La deuxième saison de Yuuki Yuuna wa Yuusha de Aru.Ayant accompli leur destin lors des événements de Yuuki Yuuna wa Yuusha de Aru, le Hero Club de l'école secondaire Sanshu, composé de Yuuna Yuuki, Karin Miyoshi et de frères et sœurs Fuu et Itsuki Inubouzaki, est de retour en plein essor, aidant ceux dans le besoin où ils peuvent. Ils ont également gagné un nouveau membre, un héros du passé nommé Sonoko Nogi. Mais finalement ils remarquent que quelqu'un qui devrait être parmi eux, Mimori Tougou, a disparu; toute trace de son existence est complètement disparue, sauf pour les souvenirs des filles. Sans aucune piste sur la localisation de Tougou, les filles retrouvent la capacité de transformer et de commencer la recherche désespérée de leur ami perdu. Mais ce qu'ils trouvent est plus choquant que n'importe lequel d'entre eux n'aurait jamais pu imaginer, et les conséquences de leurs actions commencent à changer la vie telle qu'ils le savent.