C'est une prédiction. Une crise extrême vous arrivera un jour. À ce moment-là, vous protégerez tout le monde. Daisuke Dōjima est une étudiante de deuxième année qui, enfant, a été enlevée. Daisuke, avec ses amis Gai, Lū, Marimari et Keisaku, s'enferment dans le phénomène mystérieux connu sous le nom de Shibuya Drift. La zone centrale de Shibuya s'élève et est transportée au moins 300 ans à l'avenir. Ce qui les attend, c'est un vaste désert et une forêt parsemée de ruines. Là, ils travailleront avec les futures révisions humaines pour opérer des monstres mécaniques géants. Daisuke rencontre une fille du nom de Milo, qui a le même nom que la personne qui a enlevé Daisuke. Milo informe Daisuke dit qu'il est le seul à pouvoir utiliser l'arme de poupée. Daisuke et ses amis doivent reprendre le présent en combattant l'avenir dans une ville d'isolement, contre un ennemi inconnu.