Une jeune femme se réveille dans une ville désolée sans habitants. Elle est incapable de lire des panneaux ou de se souvenir de qui elle est ou de ce qu'elle y fait. Tout ce qu'elle peut faire, c'est reconnaître les symboles qui apparaissent sur ses mains, l'identifiant comme Agarta, dévorante de dragons. Seul et dans un endroit inconnu, Agarta doit se souvenir de la raison pour laquelle elle est là et vaincre les maux à l'intérieur.