Kousaka Kyousuke, un élève normal de 17 ans vivant à Chiba, ne s'est pas entendu avec sa jeune sœur Kirino depuis des années. Pendant plus longtemps qu'il ne s'en souvient, Kirino a ignoré ses allées et venues et l'a regardé avec des yeux émouvants. Il semblait que la relation entre Kyousuke et sa sœur, maintenant quatorze, continuerait ainsi pour toujours. Un jour cependant, Kyousuke trouve un cas de DVD d'un anime de fille magique qui était tombé dans le chemin d'entrée de sa maison.