Les ninjas existent encore au Japon aujourd'hui. Ils sont environ 200 000. L'organisation ninja NIN (Renseignement National des NINJAS) n'est pas contrôlée par le gouvernement civil, ses membres d'élite effectuant des assassinats et des sabotages en secret. Il y a une organisation qui s'oppose à NIN: l'ONU (Sous Ninja). Ninja contre ninja: Qu'est-ce qui vous attend à la fin de cette sombre querelle?