Koyomi Hidaka et Shiori Sato se rencontrent au centre de recherche de son père et commencent à tomber amoureux, mais leurs parents, qui finissent par se marier. Pour éviter de devenir des stepplings, ils décident de s'enfuir vers un univers parallèle. Le voyage entre les dimensions est courant dans leur monde, mais pas sans répercussions. Un univers existe-t-il pour le jeune couple, et qu'est-ce que cela leur coûtera de le trouver?