Cho Hatsumei Boy Kanipan est une histoire de Hatsumei Boy Kanipan. Kanipan est maintenant un adolescent, et toujours un inventeur célèbre. Mais un jour, un mystérieux navire est tombé du ciel et s'est écrasé à une plage. À l'intérieur se trouvait une humanoïde féminine qui s'est oubliée. Il appartient à Kanipan de raviver la mémoire de l'humanoïde, et il découvre accidentellement que sa planète est en grand danger alors qu'il s'efforçait.