Cyborg 009 est une histoire de neuf cyborgs expérimentaux (huit hommes et une femme), qui ont été recueillis par le groupe terroriste maléfique, Black Ghost. Ces neuf cyborgs avec l'aide d'un scientifique se retournent contre le contrôle de Black Ghost. Black Ghost commence à son tour à envoyer plus de cyborgs pour détruire leurs neuf premiers cyborgs expérimentaux et causer la destruction partout dans le monde. Episodes 1-48 diffusés à la télé. Les épisodes 49-51 sont constitués par la GUERRE DE DIEU OVA. Un épisode de récapitulation supplémentaire a été diffusé entre les épisodes 47 et 49. La GUERRE DE DIEU: Prologue bonus arc n'est pas destiné à être en continuité avec les autres épisodes, car il a été plutôt produit comme un teaser à adapter le chapitre final non écrit du manga Cyborg 009. Télévision Tokyo n'a pas pu diffuser plus de 51 épisodes et les deux premiers épisodes OVA ont été coupés et fusionnés en un seul épisode, laissant le dernier non diffusé.