Virtual Station est un laboratoire qui a pour but de recueillir et de rechercher l'ADN. Avec l'information acquise par la combinaison d'anciens éléments ADN, le monde antique a été pratiquement reconstruit. Yui est l'un des Gene Divers. Elle entre dans le monde antique virtuel pour recueillir l'ADN des animaux qui sont éteints dans la réalité. Mais un incident arrive. Yui tente de quitter le monde virtuel pendant un cycle de maintenance, mais au lieu d'être retournée à la réalité, elle est transférée à un nouveau présent virtuel. Dans ce nouveau monde, généré par le système désormais incontrôlable, existe une espèce intelligente issue de rongeurs, appelée puglaitig. Ils considèrent l'existence de l'humanité comme une menace sérieuse et tentent d'arrêter l'évolution humaine par tous les moyens.