L'histoire a lieu au Japon au début du 21ème siècle, dans une autre réalité où le Shogunat Tokugawa est resté au pouvoir. Dans cette réalité, les conseils d'élèves sont chargés d'opprimer les écoles. Yagyuu Muneakira est un lycéen qui se rebelle contre son conseil étudiant avec l'aide de filles qui ont eu les noms de célèbres héros samouraïs transmis à eux.