Arès no Tenbin représente un canon alternatif à la suite des événements de la première saison de l'anime Inazuma Eleven original. Après la victoire de Raimon à la Frontière du Football, dans cet univers alternatif, l'attaque extraterrestre de la deuxième saison ne se produit jamais. Le football japonais a été jugé faible par rapport à la compétition internationale. De ce fait, les 11 Raimon ont été démantelés, et ses membres sont envoyés dans différentes équipes de football à travers le Japon dans l'espoir de renforcer le football japonais au niveau national. De plus, dans le monde moderne du football des jeunes japonais, le parrainage est devenu un aspect vital de la survie d'une équipe. Une équipe de jeunes doit avoir un parrain, sinon, leur club sera dissout, et ne sont pas autorisés à participer aux matchs. La série se concentre sur l'avant Asuto Inamori et son équipe, Inakuni Raimon, qui est composé de joueurs de l'île d'Inakunijima. Ils ont remplacé le Raimon Eleven en tant qu'équipe de soccer de Raimon Junior High, et sont en compétition en tant que sous-doyens dans le tournoi annuel de football Frontier.