En 2031, un dispositif d'énergie expérimental connu sous le nom de réacteur quantique est créé pour aider à atténuer les problèmes découlant de la diminution des réserves de combustibles fossiles de la Terre. Malheureusement, le réacteur quantique est hors de contrôle, explosant et baignant le monde avec des énergies inconnues dans un incident connu sous le nom de crise de Shouryuu. En raison des changements environnementaux catastrophiques qui suivent, l'humanité est poussée au bord de l'extinction, et d'étranges nouveaux organismes - partie organique, partie mécanique - appelés B.R.A.I. émergent. Sept ans plus tard, Léon Lau - l'un des scientifiques au centre de la crise de Shouryuu, vit dans le désert près de Neo Shouryou, l'une des dernières villes humaines restantes. Leon a conclu un contrat familial avec Chloe Lau, et ensemble, ils étudient leurs propres méthodes de lutte contre la menace B.R.A.I.