Après leur triomphe contre le haut de Yousen, l'équipe de basket-ball de Seirin a atteint les demi-finales de la Coupe d'hiver avec Kaijou, Rakuzan et Shuutoku. Chacune de ces équipes possède un membre de la Génération des Miracles, et Seirin se prépare à affronter les plus grands obstacles sur son chemin pour remporter la Coupe d'hiver. Dans la dernière saison de Kuroko no Basket, Kuroko repart en tête-à-tête avec ses anciens coéquipiers alors qu'il tente de leur montrer que la compétence individuelle n'est pas la seule façon de jouer au basketball. Sa ferme conviction que sa forme de basketball, le jeu d'équipe, est la bonne façon de jouer le sport va s'opposer aux talents d'une copie parfaite et une autorité absolue. Alors que Kuroko essaie de prouver que son basket-ball a raison, lui et le reste du Seirin High ont finalement un but : gagner la Coupe d'hiver et surmonter la force de la Génération des Miracles, qui ont longtemps dominé la scène du basket-ball moyen et secondaire.