Avec le Championnat Interhigh finalement terminé, l'équipe de basket-ball de Seirin recentre ses efforts, s'entrainant plus que jamais pour avoir la chance de participer à la Coupe d'hiver. Kuroko et Kagami voient de vieux amis revenir dans leur vie, ce qui constitue un défi à la fois sur et hors du terrain. Au fur et à mesure que de nouvelles compétences se développent et que de nouvelles alliances se créent, les ennemis de diverses équipes – des donneurs de basketball de l'école secondaire comme Yousen, Shuutoku et Touou – s'opposent aux tentatives constantes de Seirin pour atteindre le sommet. Toutes ces écoles se révèlent être des ennemis redoutables dont les capacités progressent de façon exponentielle, tandis que Kuroko lutte pour trouver un équilibre entre sa détermination à jouer dans une équipe et son désir de gagner. Avec la réouverture de vieilles blessures, de nouveaux défis à relever sur la cour, et un nouvel ensemble d'ennemis – les Rois Uncroyés – se vantant de vaincre les nouveaux espoirs, Seirin pourra-t-il jamais réaliser son rêve de battre la génération des miracles ?