Un jour, Yomogi Asanaka, un étudiant de première année à l'école secondaire Fujiyokidai, tombe sur un mystérieux homme nommé Gauma qui prétend être un utilisateur de Kaiju. L'apparition soudaine d'un kaiju est suivie par l'entrée du gigantesque robot, Dynazenon. Au mauvais endroit au mauvais moment sont Yume Minami, Koyomi Yamanaka, et Chise Asukagawa, qui sont entraînés dans la lutte contre le kaiju.