En l'an 298 de l'ère des dieux, les filles de l'école primaire Sumi Washio, Sonoko Nogi et Gin Minowa sont chargées d'une mission importante. Ils doivent devenir des héros et combattre Vertex, un ennemi mystérieux qui attaque Shinju-sama, le dieu arbre qui protège Shikoku, la seule zone du monde qui est encore habitable. Ce qu'ils ne savent pas, c'est que ce combat leur coûtera plus cher qu'ils ne l'auraient jamais imaginé.