Après cinq ans à entretenir des sentiments tacites, le lycéen Taiju Ooki est enfin prêt à avouer son amour à Yuzuriha Ogawa. Juste au moment où Taiju commence sa confession cependant, une lumière verte aveuglante frappe la Terre et pétrifie l'humanité à travers le monde-transformant chaque humain en pierre.Plusieurs millénaires plus tard, Taiju se réveille pour découvrir que le monde moderne est complètement inexistant, car la nature s'est épanouie au cours des années où l'humanité s'est arrêtée. Dans un monde de statues de pierre, Taiju rencontre un autre humain vivant: son ami passionné de science Senkuu, actif depuis quelques mois. Taiju apprend que Senkuu a développé un grand projet-pour lancer la renaissance complète de la civilisation avec la science. Les muscles de Taiju et le cerveau de Senkuu se combinent pour forger un formidable partenariat, et ils découvrent bientôt une méthode pour réanimer ceux pétrifiés.Cependant, le plan directeur de Senkuu est menacé lorsque ses idéologies sont contestées par ceux qui s'éveillent. Pendant tout ce temps, la raison de la pétrification de l'humanité reste inconnue.